На сегодняшний день единого мнения о механизме развития никотинового стоматита нет. Безусловно, смолы, содержащиеся в табачном дыме, оседают на слизистой рта, так или иначе провоцируя ее раздражение. При этом возникает ответная иммунная реакция организма, развивается воспаление. Однако стоматит развивается не у всех курящих — вероятно, играет роль также действие сопутствующих факторов: особенности питания (в частности, любовь к острой, кислой, горячей пище), употребление крепких алкогольных напитков, прием некоторых лекарств, состояние авитаминоза, некоторые аллергические реакции. Способствуют стоматиту неправильная или недостаточная гигиена рта, неправильно установленные зубные протезы, а также особенности состава слюны (повышенная склонность к образованию зубного камня). Один из важных факторов, способствующих воспалению слизистой — нарушение баланса бактериальной микрофлоры ротовой полости, причем дисбактериоз развивается не только вследствие приема антибиотиков или применения для ухода за зубами антибактериальных паст и ополаскивателей. Табачный дым, изобилующий токсинами, сам по себе способствует гибели полезных бактерий, населяющих ротовую полость.